Rayyan：一种新型在线文献管理软件在系统评价中的应用

李洁莉，李胜，徐畅，张超，黄静宇，阮晓岚，李卓

文献筛选是系统评价/Meta分析中重要的一个步骤，筛选过程在一定程度上能反映系统评价/Meta分析的质量[1]。当前较为常用的文献管理软件有Endnote、Note Express、Reference Manager等[2]。其中，Endnote、Reference为国外软件，而Note Express为国内软件，均具有强大的文献管理功能。这些软件给系统评价/Meta分析的制作带来了极大便利[3]。与此同时，这些软件均为收费软件，在一定程度上限制了其应用。

卡塔尔计算机研究所（Qatar Computer Research Institute）于2015年推出了一款在线文献管理软件，Rayyan，通过网页操作即可实现文献管理的功能[4]。该软件完全免费，用户通过邮箱注册后即可使用。并且该软件可对文献筛选者实施盲法处理，为规范文献筛选流程提供了很好的解决方案。相对于传统文献筛选软件，Rayyan具

备一些特殊功能，比如根据关键词对纳入文献进行自动评级。本文对Rayyan软件进行详细介绍，以期为循证实践提供相关理论参考。

1 软件的获取及注册

1.1 软件的获取 Rayyan在线网页应用程序可通过其官方网站直接访问：https://rayyan.qcri.org。同时，Rayyan还发布了手机应用程序——Rayyan QCRI，在苹果应用商店下载相关应用程序（app）后安装即可免费使用[4]。

1.2 软件的注册 Rayyan默认的注册（Sign Up）方式为邮箱注册，在官方网页点击Sign up菜单后，填写邮箱、头衔、姓、名、职位、单位、所在国家、注册理由等信息后，即可注册（图1）。Rayyan也支持“访客账户”，即无需注册通过Access as guest（访客形式使用）可直接进入功能页面。

2 软件的功能介绍

2.1 软件主要页面介绍 注册成功（或以访客形式使用）后，即进入主要界面（图2）。主界面存在四个菜单分别为：My Reviews（我的系统评价）、Collaboration Reviews（合作的系统评价）、Translation only Reviews（仅翻译的系统评价）、Other Reviews（其他系统评价）。其中使用最多的为My Reviews和Collaboration Reviews。

图1 Rayyan注册界面

图2 Rayyan主要功能界面

在My Reviews菜单下，点击“New review”新建一个系统评价，依次输入系统评价标题、描述（可选）、并导入相关文献后即可进行相关操作（图3）；而Collaboration Reviews需收到其他作者邀请后可进入该系统评价小组参与文献管理工作。Other Reviews菜单下为系统放置的示例。在主菜单下面，还有个独立菜单：Show archived reviews，作用为显示归档的系统评价。在系统评级完成或放弃制作后，可进行归档处理。

2.2 软件主要功能介绍 Rayyan主要有四种功能：新建系统评价、导入文献、筛选文献、导出文献。新建系统评价的实现如前所述。Rayyan同时具有兼容性较强的文献导入功能，可直接导入Endnote或其他文献管理软件导出的格式，也支持数据库导出的格式。在新建系统评价后，会进入Upload References（上传文献）页面（图4），页面右侧列出了支持文献的格式。支持的主要格式有：Endnote Export格式（.enw）、Refman/RIS格式（.ris）、BibTex格式（.bib）、CSV格式（.csv）、PubMed XML格式（.xml）、Web of Science/CIW格式（.ciw）。另外，Rayyan还支持一些其他格式，如Txt、docx。

选择（Select files）对应格式的文件后，点击“Continue”上传文件（图4）。在My Reviews或受邀请的Collaboration Reviews下找到新建的系统评价题目（图5），即可进行文献筛选操作。界面下有四个子菜单：Show（显示）、Invite（邀请）、Archive（归档）、Delete（删除），分别对应显示文献管理主页面、邀请系统评价员参与文献管理或筛选、对系统评价进行归档、删除系统评价。文献筛选在点击“Show”菜单后进入的文献管理主页面进行。

图3 新建系统评价界面

图4 文献导入

原则上文献筛选要求由2名评价员分别单独筛选，因此至少需要另邀请1名评价员进行文献筛选[5]。Rayyan文献筛选功能支持对2名（或多名）评价员实施盲法处理，通过“Blind on”（打开盲法）菜单实现，由第3位评价员设置盲法后，所有被邀请作者，特别是进行文献筛选的2名作者无法看到对方进度和对文献的决定。该功能有效保证了文献筛选过程的规范性。当然，通过点击“Blind off”（关闭盲法）菜单，也可不对筛选过程实施盲法，即所有被邀请作者可以看到筛选过程、进度以及文献筛选员的判断。原则上需待2名文献筛选员完成筛选后，再关闭盲法功能，用以了解不一致的判断，计算一致程度（通常使用Kappa检验），并进一步通过讨论解决不一致的判断。文献导出功能则由Export选项实现，将在后文中进行介绍。

3 文献筛选

3.1 文献筛选窗口 本处以软件自带的示例对相关操作进行演示。在Other Reviews页面下找到自带的系统评价题目“ [Public]2014-04-15:EMOLLIENTS 4984(4936 articles)”并点击“Show”菜单进入文献筛选页面（图6）。文献筛选界面有3个窗口。

最左侧的窗口显示“EMOLLIENTS 4984”这项系统评价文献情况。包括重复文献（266篇）及相关处理（删除、已解决等）、文献状态（纳入、排除、待定）、文献判定作者列表（Prof ZbysFedorowicz等）、关键词纳入列表（如：randmoized）、关键词排除列表（如：this review）。其中文献状态栏显示纳入文献（128篇）、排除文献（4936篇）、待定文献（109篇）、决定不一致的文献（1篇）。关键词纳入列表，可通过在相应菜单（Keywords for inclusion）添加相关关键词，表示文献题目和摘要中包含词关键词时，有可能被纳入；同样，对于关键词排除列表，可通过在相应菜单（Keywords for exclusion）添加关键词，表示文献题目和或摘要包含该关键词时，有可能被排除。并且系统会根据作者添加的关键词，对所有文献进行初步判定，并给出可能纳入（排除）的等级，以5颗星表示。当文献获得5颗绿颜色星时（对应0颗红星），表明该文献有很大可能性被纳入，反之，当文献仅获得半颗绿色星时（对应4颗半红星），表明该文献有很大可能被排除。

位于右上的窗口，显示该系统评价新建日期（2014-04-15）、题目及导入文献数量（4936个）。并给出对应文献列表。例如，在左侧窗口

图5 新建的系统评价

点击Undecided后，页面就列出这109篇待定文献的列表。在列表中选择任一文献题目“Efficacy and safety of tacrolimus ointment compared with hydrocortisone treatment in adults with moderate-tosevere atopic dermatitis Abstract”，该文献的题目、摘要及其他信息就会显示在右下侧的窗口，如图6所示。

3.2 文献筛选 由示例（图6）所示，在“EMOLLIENTS 4984(4936 articles)”这篇系统评价下，经过Ranyan自动识别，有266篇重复文献。共4698篇文献被排除，128篇被纳入，1篇存在争议，109篇待定。我们从待定的109篇列表中选择其中1篇，点击题目后可看到页面中部有三个选项：Include（纳入）、Undecide（待定）、Exclude（排除）。并且选项旁边有两个附加功能：Reason和Lable。Reason用于给出排除理由，可自行添加。Lable则对该文献进行进一步标识。根据文献题目和摘要，判断是否纳入或排除。并选择相关选项，即可完成该文献的筛选。本篇文献我们选择排除后，该文献即被移至左侧窗口Exclude栏目，且该栏目数字会增加1，而Undecide栏目数字则会减少1。

3.3 其他功能 页面右上角（图6）有个Rating选项，也即系统对每篇文献的评价。如我们选择的文献评级为2星半（绿色），表明系统认为，该文献纳入和排除的几率接近。点击Rating后，系统会对所有文献按照评级进行排序。用户通过Rating上方的Search功能可根据关键词等搜索相应文献。Search搜索框上方则又有几个选项（访客形式进入显示3个、新建的系统评价显示4个），分别为Display mode（显示模式）、Export（数据导出）、Copy（复制）、All reviews（返回所有系统评价列表）。其中Display mode可用于选择显示的模式，系统默认为列表（List）形式，还可根据个人爱好，选择相似图（Similarity graph）形式呈现所有结果。Export用于导出数据，导出格式主要以.enw及.ris为主。值得注意的是，导出的文件是以压缩文件导出，导出后需先进行解压后再进行其他操作。

图6 Rayyan文献筛选界面

4 与Endnote软件的比较

我们将Rayyan与当前最常用的Endnote软件进行相关比较。Rayyan在功能上与Endnote存在许多类似的地方，但与Endnote仍有一些差别[3]。比如，前者为在线应用程序，而后者为桌面应用程序；前者为免费软件，后者为收费软件等。表1列出了部分Rayyan和Endnote的异同点。

表1 Rayyan与EndNote软件的比较

5 讨论

本文对一款新型在线文献管理软件Rayyan进行了详细介绍，通过实例演示了如何使用Rayyan进行文献筛选，并比较了Rayyan与传统Endnote软件的异同点。Rayyan是一款操作简单，使用便利的文献管理软件。同时，我们发现Rayyan在部分功能上优于Endnote，如Rayyan为免费软件，支持评价者盲法，支持关键词评级功能，这些都是Endnote所不具备的。但不可否认，Endnote很多功能Rayyan是不支持的，如文献检索功能。

从文献筛选功能上，Rayyan相对于传统文献筛选软件有着较大的优势。首先，其在线应用环境，方便于系统评价作者进行国际性质的合作，增加了合作效率；其次，Rayyan的关键词排除、关键词纳入功能，配合使用关键词评级功能，能显著增加文献筛选效率，减少系统评价整体制作时间，降低发表延迟带来的偏倚风险；再次，Rayyan的评价者盲法功能，有效规范文献筛选流程，保证文献筛选质量，同时Rayyan的文献筛选归类方式，对计算一致性（Kappa）十分便利[6]。

但Rayyan存在一些缺陷。最主要的缺陷在于Rayyan依赖于网络连接。仅在网络连接成功的情况下Rayyan才能被使用，若无网络连接，则无法使用，对于Endnote这类桌面应用程序则不存在此种情况；同时，Rayyan的文献筛选效率，取决于网络连接速度。当网络连接速度较慢时，文献筛选速度则相应降低；其次，Rayyan不支持全文查找功能，只能通过手动下载全文后进行上传，而Endnote等经典文献筛选软件支持自动查找并下载全文的功能。

总之，Rayyan是一款较为方便的文献管理软件，能提高文献筛选效率，对于系统评价/Meta分析的制作效率及流程有非常积极的意义。

[1]詹思延. 第一讲:如何报告系统综述和Meta分析——国际报告规范QUOROM和MOOSE解读[J]. 中国循证儿科杂志,2010,5(1):60-3.

[2]焦艳平,Su Hanfling,孙彩霞,等. EndNote个人参考文献图书馆简介与基本使用方法[J]. 现代图书情报技术,2004,20(4):82-4.

[3]张兆伦. 三个参考文献管理软件的比较应用研究——EndNote,Reference Manager与ProCite[J]. 图书情报工作,2007,51(11):121-3.

[4]Ouzzani M,Hammady H,Fedorowicz Z,et al. Rayyan-a web and mobile app for systematic reviews[J]. Syst Rev,2016,5(1):210.

[5]Higgins,Julian PT,and Sally Green, eds. Cochrane handbook for systematic reviews of interventions[M]. John Wiley & Sons,2011.

[6]Liu TZ,Xu C,Rota M,et al. Sleep duration and risk of all-cause mortality: A flexible, non-linear, meta-regression of 40 prospective cohort studies[J]. Sleep Med Rev,2017, 32:28-36.