中国科学院植物研究所,北京 100093
孟德尔 (Johann Gregor Mendel) 1866 年发表的论文“植物杂交实验”,直到 1900 年才被引用,随后突然被大量引用,就像被唤醒一样。荷兰学者van Raan(2004) 称这种现象为“科学中的睡美人”[1],随后的研究发现,类似的“睡美人”现象在历史文献中并非个例。同样,在标本馆各种各样的标本中也沉睡着大量这样的“科学睡美人”。每一份标本都凝聚了科学家的大量心血,具有一定的分类学意义和科学价值,因此,也可以说每一份标本都是“科学睡美人”。标本数字化就是在唤醒沉睡在标本馆里的“科学睡美人”,让她们活起来,借助于数字化和互联网技术,为科学研究以及全民科学素养提升做出更大的贡献。
近年来,随着生物信息学的快速发展,生物标本作为生物多样性信息学发展的重要载体,被越来越多的国家和机构重视[2]。各个国家,特别是一些发达国家,都在积极推进生物标本数字化工作。2003 年我国科技部启动了“标本资源的标准化整理、整合与共享平台建设项目”。在该项目的持续支持下,国家标本资源共享平台 (NSII) 已经成为国家科技部认定并资助的 28 个国家科技基础条件平台之一。该平台汇集了植物、动物、岩矿化石和极地标本大量数字化信息,为相关领域研究提供最具权威的数据支撑和协同研究平台服务。
肖翠等 (2017) 对已经数字化的标本信息进行了全面地分析,包括数据总量、标本数字化年变化量、不同省份动植物标本的变化趋势、动植物标本的科属总量的变化规律、全国重要的标本馆已经数字化标本量的统计、动植物标本图片数据统计等,系统而全面地总结了我国标本资源数字化的发展现状。从而提出NSII 发展具体建议。雒海瑞等 (2017) 基于 NSII 网页浏览日志中标本查询页面中的用户检索关键词进行了分析,得出用户访问最多的物种清单、馆藏信息、地理分布信息以及不同国家和省份的用户浏览次数最多的物种清单,一定程度上揭示用户对不同物种、不同地理分布和馆藏分布的关注度,从而确定热点物种。
国家标本资源共享平台包含有 6 个子平台,他们分别是植物子平台、动物子平台、岩矿子平台、教学子平台、保护区子平台和极地子平台。刘慧圆等(2017) 、崔兴辉和李大立 (2017) 、何明跃等 (2017) 分别对植物标本子平台、动物标本子平台和岩矿标本子平台标本数字化、平台建设、数据资源、专题库建设、以及为相关领域研究提供的服务进行系统全面的分析和总结,并对子平台和总平台的今后工作提出了富有建设性的意见和建议。
国家标本资源共享平台和 6 子平台除了提供标本数据服务外,还为各具特色的专题数据库建设、各种专项研究提供了很好的空间和相关技术服务。林祁等 (2017) 以植物研究所国家植物标本馆维管束植物模式标本数字化建设为例,详细介绍了规范化整理模式标本的方法、模式标本数字化的操作流程,以及常见问题的处理方法等,为其他单位开展模式标本数字化建设提供了很好的模式和范例。黄雄伟等 (2017) 探讨如何建立 BDGA 工作流,着重阐述 BDGA 的基本方法、相关工具与流程,为今后的生物多样性调查与研究工作提供决策支持,帮助相关研究人员在应用生物多样性数据时对数据客观性和可用性进行判断。邵梦媛等 (2017) 详细介绍了古生物群专题数据库的建设思路和方法,为标本资源专题数据库的构建提供了示范和参考。王嘉宁等 (2017) 以《化石复原生命奇迹——中国侏罗纪恐龙动物群》为例,探讨了地学标本平台多媒体产品的研发的前景和开发路径,为地学类多媒体产品研发提供参考。徐洲锋 (2017) 详细介绍昆明植物研究所以公民科学为核心构建了生物多样性协同与共享平台的实践和经验,为探索公民和爱好者参与相关科学数据库建设和相关科学研究提供范例。薛涛涛等 (2017) 主要分析了中国蚌科物种数据库的特点及其应用。赵思艺和何明跃 (2017) 以国家岩矿化石资源共享平台矿物晶体标本的三维展示技术为例,阐述了环物摄影技术的设计过程与实现方式,以及在矿物晶体标本展示中的应用。
[1]van Raan, A. F. J. (2004). Sleeping beauties in science.Scientometrics, 59, 467-472.
[2]肖翠,雒海瑞,陈铁梅,马克平.国家标本资源共享平台数字化进展与现状分析[J].科研信息化技术与应用, 2017,8(4):6-12.
[3]刘慧圆,覃海宁,李敏.植物标本资源共享平台与标本数字化能力建设[J].科研信息化技术与应用,2017,8(4):13-23.
[4]何明跃,杨眉,吴志远.国家岩矿化石标本资源共享平台的构建[J].科研信息化技术与应用,2017,8(4):24-31.
[5]张莉莉,李大立,周丽,陈军.我国动物标本资源共享平台建设与展望[J].科研信息化技术与应用,2017,8(4):32-35.
[6]雒海瑞,肖翠,陈铁梅.基于 NSII 网页浏览日志分析用户对物种的关注度及其关注点变化[J].科研信息化技术与应用,2017,8(4):36-41.
[7]黄雄伟,林聪田,纪力强.生物多样性数据 Gap 分析工作流[J].科研信息化技术与应用,2017,8(4):42-50.
[8]赵思艺,何明跃.矿物晶体标本的三维可视化展示设计与实现[J].科研信息化技术与应用,2017,8(4):51-56.
[9]崔兴辉,李大立.动物标本资源共享平台信息化及专题数据库的建设与应用[J].科研信息化技术与应用,2017,8(4):57-62.
[10]林祁,杨志荣,包伯坚,等.植物模式标本的考证与数字化:以中国国家植物标本馆为例[J].科研信息化技术与应用,2017,8(4):63-76.
[11]邵梦媛,杨眉,何明跃.古生物群专题数据库的构建与展示[J].科研信息化技术与应用,2017,8(4):77-82.
[12]薛涛涛,谢广龙,吴小平,陈军.中国蚌科物种数据库的特点及应用[J].科研信息化技术与应用,2017,8(4):83-89.
[13]王嘉宇,何明跃,严薇.基于地学标本资源平台的多媒体产品研发——以《化石复原生命奇迹—中国侏罗纪恐龙动物群》为例[J].科研信息化技术与应用,2017,8(4):90-96.
[14]徐洲锋.结合公民科学的kingdonia协同工作平台的构建与应用[J].科研信息化技术与应用,2017,8(4):97-105.