单核苷酸多态性与胃癌易感性的相关性

2014-09-04 03:34刘小春
实用临床医药杂志 2014年19期
关键词:易感性核苷酸多态性

邱 钢, 朱 畅, 刘小春

(广东省深圳市龙岗区第三人民医院, 1.普外科; 3.胃镜室, 广东 深圳, 518115;2.广东省深圳市第一人民医院 胃肠外科, 广东 深圳, 518020)

胃癌是全世界最常见的恶性肿瘤之一,大部分的胃癌患者确诊时都属于中晚期。研究[1]结果表明,基因的多态性与胃癌的发生有着密切的关系。利用飞行时间质谱基因分型系统(MassARRAY Assay)高通量技术,选取新的与胃癌有相关性的若干易感基因位点,对大样本人群进行胃癌相关基因单核苷酸多态性(SNP)研究,有助于发现调控胃癌癌变的关键机制和主要靶点,更好地解释基因位点突变与胃癌易感性之间的关系[2], 为胃癌的早期筛查、诊断、制定个体化治疗方案、判断治疗效果等提供依据。本研究主要探讨了单核苷酸多态性与胃癌易感性的相关性,旨在为胃癌的发病机制及临床诊治提供一定的参考依据,现将结果报告如下。

1 资料与方法

1.1 一般资料

回顾性分析了2009年12月—2013年12月入住两院的120例胃癌患者的临床资料,其中男67例,女53例;年龄32~76岁,平均(58.71±5.99)岁;另外选择同期在本院进行体检的健康者112名作为对照组,其中男60例,女52例;年龄30~73岁,平均(55.20±5.07)岁。80例病例相应蜡块均源自手术切除且经WHO病理学诊断标准证实为胃癌组织,其中乳头状癌23例(28.75%), 管状腺癌24例(30.00%), 黏液腺癌25例(31.25%), 印戎细胞癌8例(10.00%); 另外选择24例癌旁正常黏膜组织作为对照。

1.2 方法

2组患者于空腹状态下取静脉血,分别采集5 mL, 通过TAINGEN公司所提供的DNA提取试剂盒(DP304-03)对其加以提取,并将其保存于Buffer TE中,同时保证纯化核酸OD260/OD280值的范围为(1.8±0.1), 且将基因组的DNA水平保持在100~300 ng/L的范围内,然后注射EDTA抗凝剂,存储于-20 ℃~80 ℃条件下,直至测序开始。然后对DNA的浓度进行标化, 2组患者采取EZH2 rs734004、rs734005、rs2072407、rs6464926及rs12670401多态性进行测序,应用组织芯片技术与免疫组化检测80例同源胃癌组织与24例癌旁正常胃黏膜组织EZH2蛋白的表达情况[3]。

1.3 观察指标

比较患者组EZH2中rs12670401基因型CC与正常血样中rs6464926基因型TT,胃癌患者中的EZH2包含的杂合基因型rs2072407TC、rs734004TC以及rs734004CG与正常血液中的杂合基因型之间的构成比,分析基因型对胃癌的发生风险产生的影响。

2 结 果

2.1 2组一般资料比较

2组在年龄、性别、吸烟史、癌症家族史方面经检验差异均无统计学意义(P>0.05), 见表1。

表1 2组一般资料比较[n(%)]

2.2 EZH2基因单核苷酸多态性与胃癌风险的相关性分析

rs12670401最小等位基因C与rs6464926最小等位基因T增加,其胃癌发生风险较大(OR>1),而其余三种多态性则会降低胃癌发生风险,见表2。

表2 EZH2基因单核苷酸多态性与胃癌风险的相关性

2.3 各基因型在胃癌患者组与对照组的分布情况分析

经Codominant模型、Dominant模型及Recessive模型分析,rs12670401CC与rs6464926CT构成比显著高于对照组,可增加胃癌的发生风险(OR>1), 胃癌患者中杂合基因rs2072407TC、rs734005TC及rs734004CG构成比均显著低于对照组,可降低胃癌的发生风险(OR<1), 见表3。

表3 各基因型在胃癌患者组与对照组的分布情况

3 讨 论

胃癌是胃肠黏膜发生的恶性肿瘤。胃癌是一个全球性疾病,在癌症相关死亡中位列第2位[4-5],在中国是最常见的消化道恶性肿瘤,发病率和死亡率均居各类恶性肿瘤首位。近年来,胃癌的发病具有明显的年轻化趋势。过去以40~60岁年龄组居多,现在则以35~55岁年龄组为多。19~35岁的青年患者有明显增加,占到胃癌总数的6%~11%。年轻人不重视胃部不适,就诊晚、发现晚,且其胃癌细胞分化较差,恶性程度较高,是年轻人胃癌治疗效果不佳、生存时间较短、预后差的根本原因[6]。在中国,江苏省、山东省、浙江省、上海市、辽宁省及福建省等沿江沿海地区为胃癌高发区,原因不明,有学者认为可能与沿海环境和海产食物受致癌物污染有关[7];但是还有西北地区(青海、宁夏、甘肃)发病率也高;另外,胃癌还有一定的家庭性聚集的倾向[8]。可见胃癌的发病原因也是非常复杂的。其发生与其他肿瘤一样,是多因素综合作用的结果,其中既有环境因素的影响,特别是幽门螺杆菌(HP)感染、饮食因素和生活行为方式,亦有机体内部因素的影响,包括遗传因素、社会心理因素等[9]。事实上并非所有暴露于同一种环境因素的个体都会患胃癌,这说明胃癌的发病除了与暴露于外界各种环境因素、生物因素持续作用有关,还与个体的遗传易感性存在着非常密切的关系。这种遗传易感性是由于个体在环境致癌因素及生物因素共同作用下表现出与肿瘤相关的易感基因发生了变异,最终导致了肿瘤的发生[10]。

单核苷酸多态性(SNP)是人类基因组中最常见的遗传多态性,是一个可以比较好地反映个体遗传差异的分子标记,在人类基因组中密度最大、发生频率较高,人体许多表型差异、对药物或疾病的易感性等等都可能与SNP有关[11]。因此,SNP研究能作为一个强有力的工具,用于高危群体的发现、疾病相关基因的鉴定、药物的设计和测试以及生物学的基础研究等。SNP在基因组中分布相当广泛,近来的研究[12]表明在人类基因组中每300碱基对就出现一次。大量存在的SNP位点,使人们有机会发现与各种疾病,包括肿瘤相关的基因组突变;从实验操作来看,通过SNP发现疾病相关基因突变要比通过家系来得容易;有些SNP并不直接导致疾病基因的表达,但由于它与某些疾病基因相邻,而成为重要的标记,从中能够发现各种复杂疾病的遗传易感因素,从而可以寻找出人类各种与遗传相关疾病的复杂的发病原因[13]。对确定高危人群、寻找疾病标志物及个体化医疗方案的制定均有重要价值。

Yoon等[14]学者认为EZH2rs6950683和rs3757441多态性与肺癌易感性有关,基因型AA(rs6950683)和基因型CC(rs3757441)可以降低韩国人群肺癌发生风险,起保护作用(OR=0.71,P<0.007; OR=0.73,P<0.015)。作者发现,rs12670401最小等位基因C与rs6464926最小等位基因T增加,其胃癌发生风险较大;而其余三种多态性则会降低胃癌发生风险。此外,本研究结果还显示,rs12670401CC与rs6464926TT构成比显著高于对照组,可增加胃癌的发生风险

(OR>1),胃癌患者中杂合基因rs2072407TC、rs734005TC及rs734004CG构成比均显著低于对照组,可降低胃癌的发生风险。

[1] Ahmedin Jemal, Freddie Bray, Melissa M.Center, et al.Global Cancer Statistics.CA Cancer J Clin[J].2011, 61(2): 69.

[2] Pleasance, E.D.A comprehensive catalogue of somatic mutations from a human cancer genome[J].Nature,2010, 463: 191.

[3] 胡晓鹏, 周翔, 罗智勇, 等.单核苷酸多态性SNP(rs34040607)与中国人胃癌相关性研究[J].现代生物医学进展, 2013, 13(27): 5209.

[4] Christian C Abnet, Neal D Freedman, Nan Hu, et al.Genome-wide association studies of gastric adenocarcinoma and esophageal squamous cell carcinoma identify a shared susceptibility locus in PLCE1 at 10q23[J].Nat Genet, 2010, 42(9): 764.

[5] Lei Yang , Yinyan Li , Xiaoxuan Ling, et al.A Common Genetic Variant (97906C.A) of DAB2IP/AIP1 Is Associated with an Increased Risk and Early Onset of Lung Cancer in Chinese Males[J].PLoS One, 2011, 6(10): e26944.

[6] KRISTA L.LANCT T, MARK J.RAPOPORT, FLORANCE CHAN, et al.Genetic predictors of response to treatment with citalopram in depression secondary to traumatic brain injury[J].Brain Inj, 2010, 24(7/8): 959.

[7] 杨巧媛, 揭志刚, 王进, 等.miRNA-196a-2基因多态位点rs11614913与胃癌易感性的关联研究[J].广州医学院学报, 2013, 41(3): 13.

[8] 张军峰, 张春兵, 吴娟, 等.胃癌患者舌苔变化与表皮生长因子受体基因单核苷酸多态性的相关性分析[J].北京中医药大学学报, 2013, 36(10): 665.

[9] 从丽, 陶林, 赵瑾, 等.胃癌组织中Stat3的活化及P53、C-erb-B2的表达[J].中国实验诊断学, 2013, 17(5): 896.

[10] Mian Li, Yanhong Zhou, Peizhan Chen, et al.Genetic Variants on Chromosome 8q24 and Colorectal Neoplasia Risk: A Case-Control Study in China and a Meta-Analysis of the Published Literature[J].PLoS One, 2011, 6(3): e18251.

[11] 孙珉丹, 吴昊, 王飞宇, 等.中国长春地区汉族人转化生长因子β1(TGF-β1)基因工程509C/T多态性与IgA肾病易感性的相关性[J].中国实验诊断学, 2013, 17(1): 109.

[12] 冉恒泉, 周勇, 陈博, 等.MDM2-309 T>G基因多态性与东亚人群胃癌风险关系的Meta分析[J].中国循证医学杂志, 2013, 13(5): 560.

[13] 刘佳骅, 沈艳莹, 倪醒之.FGFR4基因单核苷酸多态性和杂合性丢失在胃癌发病中的作用[J].上海交通大学学报: 医学版, 2013, 33(2): 191.

[14] Yoon K A, Gil H J, Han J, et al.Genetic polymorphisms in the polycomb group gene EZH2 and the risk of lung cancer[J].J Thorac Oncol, 2010, 5(1): 10.

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