雷 蕾 杨 策 温先荣 邢雁辉 刘 骏 王 忠(中国中医科学院中医药信息研究所,北京,00700;中国中医科学院中医临床基础医学研究所,北京,00700)
基于复杂网络的心绞痛血瘀证中药组方研究
雷 蕾1杨 策1温先荣1邢雁辉1刘 骏2王 忠2
(1中国中医科学院中医药信息研究所,北京,100700;2中国中医科学院中医临床基础医学研究所,北京,100700)
作者基于中医临床文献数据,从临床治疗心绞痛血瘀证的方剂出发,使用复杂网络算法构建了中药网络,计算了中药的点中心度(degree)、中间中心度(betweenness centrality)和接近中心度(closeness centrality),以及使用凝聚子图CONCOR迭代相关收敛法分析了中药的聚类情况。结果发现丹参、川芎、黄芪、红花、赤芍的点中心度、中间中心度和接近中心度都较高,为治疗心绞痛血瘀证的核心药物。聚类结果显示,中药可聚类为27个子群,其中4个子群(中药组合)在中药新药处方筛选上有一定的应用价值。为了分析处方内部中药可能的配伍关系,作者对子群进行了二级凝聚子群分析,进一步计算了二级子群的密度,并结合中医理论给出了解释。结论:复杂网络算法可以有效辅助治疗心绞痛血瘀证中药组方的研究。
复杂网络;心绞痛血瘀证;中心度;凝聚子图;ucinet软件
冠心病作为临床常见的生活方式相关疾病,是主要的公共健康问题之一[1],主要影响人群为老年人[2]。2011年,通过对近40年冠心病中医证候特征的研究文献分析,毛静远等人发现冠心病为本虚标实的疾病,其中标实中以血瘀为首(22 101例次占28.10%)[3]。在冠心病的证候分布中,血瘀证是很重要的一个证候类型[4]。但是由于本证兼证复杂,病机转化多端,临证时辨证论治,用药灵活多样,因此有必要对心绞痛血瘀证的临床方剂组方规律进行研究,为临床治疗提供参考。如果将每味中药看作一个节点,药物组配关系看作边,那么临床方剂就可以形成一个复杂网络[5],可以使用复杂网络研究方法分析中药网络的特点和规律,从而揭示中药的配伍规律[6]。事实上,复杂网络已经用于方剂的配伍规律研究,张润顺等[7]使用复杂网络分析了肝脾不调证的配伍特点,李明等[8]分析了汉唐止痛方剂的特点,高株烨等[9]分析了冠心病证候-治法-中药的关系。我们在本文以治疗冠心病心绞痛血瘀证的临床文献为基础,使用复杂网络来分析治疗血瘀证的中药组方规律,找到关键中药和中药组合,并得到了一些有意义的结果。
1.1 资料来源 本试验使用的数据来自中国中医科学院中医药信息研究所研制开发的《中医临床诊疗文献数据库》,数据库由人工摘录的方式从中医临床治疗文献中收集与疾病证候、方剂、中药相关信息[10]。
本试验根据关键词“心绞痛”和“血瘀证”在《中医临床诊疗文献数据库》中筛选1988年以来的中医药临床文献655篇,收集信息包括证候名称、临床使用方剂名称和方剂组成。
1.2 复杂网络算法介绍[11]如果将复杂系统内部的各个部件抽象为节点,部件之间的关系抽象为边,那么就构成了一个具有复杂连接关系的网络,通常称之为复杂网络。复杂网络有3个基本统计特征,包括小世界(SmallWorld)特征、二是无尺度(Scale Free)特征和集聚(Clustering)特征。最新研究还发现它们具有社团结构(Community Structure)和层次结构特性(Hierachical StnJcture)。如果中药网络是复杂网络,那么它就具有复杂网络的特性,我们就可以使用复杂网络的参数来研究中药的用药、特点和组合规律。本文中使用了点度中心度(degree)、中间中心度(betweenness centrality)、接近中心度(closeness centrality)和凝聚子群来研究在治疗冠心病血瘀证的方剂中哪些中药是核心药物,拥有怎样的关键性地位,以及中药组合之间的关系。
1.2.1 点度中心度 在一个药物网络中,如果一味中药与很多其他中药之间存在直接联系,那么该中药就居于中心地位,在治疗疾病时可能发挥较大的作用。因此,点度中心度就可以用网络中与该点有直接联系的点的数目来计算。点度中心度又分为绝对点度中心度和相对点度中心度。绝对点度中心度是与该点直接联系的点的个数;相对点度中心度是绝对中心度与网络中点的最大可能的度数之比。在比较不同规模的网络时,常常使用相对点度中心度。
1.2.2 中间中心度(betweenness centrality) 中间中心度指一味中药在其他中药之间相连的最短路径上担当“中介”角色的程度。在一个网络中,如果一味中药处于许多其他中药之间的路径上,可以认为该中药居于重要地位。
1.2.3 接近中心度(closeness centrality) 如果一味中药通过比较短的路径与许多中药相连,那么就认为这味中药具有较高的接近中心度。高接近中心度意味着一个中药可以接触到网络中的许多其他中药,并因此相对不受其他中药的影响。同时也表明自身的药效较为显著,当使用这些中药进行治疗时,可以通过最少的药物配伍达到治疗效果。
1.2.4 凝聚子群分析 凝聚子群分析[12]是将子群从整个网络中分离出来从而了解子群对整体网络的影响。根据不同的计算原理有不同的凝聚子群定义及分析方法。凝聚子群分析可以研究中药之间关系的紧密程度,可以判断出哪些中药之间的关系比较紧密,联系紧密的中药之间在药性,功效等方面是否具有某些关系等信息。本文使用CONCOR迭代相关收敛法[13]将一个图分为一些相对独立的子图,并对子图进行了分析。
1.3 数据处理 本文使用Ucinet 6.0软件[14]完成了复杂网络的计算。首先本文根据中国中医科学院中医药信息研究所编写的《中医药主题词表》和《中医药标准表》对中药名称进行规范,将多个异名规范成一个正名。然后,使用中药的二元关系矩阵,即设定如果中药A和中药B同时出现在一首方剂中,则A和B之间存在某种关系,记为“1”,否则记为“0”,得到中药关系矩阵如表1所示。
表1 二分法得到的中药的相关矩阵表示
2.1 治疗心绞痛血瘀证的中药统计 从655篇临床文献中统计得出,心绞痛血瘀证共出现28种证候,出现频次排在首位的是气虚血瘀证,其次是心血瘀阻证,第三是气滞血瘀证。涉及525首方剂,共包含203味中药。方剂最多的是自拟方,中药使用频次前十位的是:丹参、川芎、黄芪、红花、赤芍、当归、桃仁、三七、甘草、党参。
2.2 点度中心度、接近中心度和中间中心度分析 如表2显示,点度中心度排名最高的前几位分别是丹参,川芎,黄芪,红花和三七。点度中心度最高的丹参,其绝对点度中心度是173,表明丹参与其他173个中药有直接联系,相对点度中心度是0.86,表明该点的绝对中心度与图中点的最大可能的度数之比为0.86。接近中心度最高的前五位仍是丹参,川芎,三七、红花,黄芪,中间中心度最高的前五位为丹参、川芎、三七、黄芪、人参。
2.3 凝聚子群分析 为了分析心绞痛血瘀证中药之间的组合关系,本文使用CONCOR迭代相关收敛法将中药网络图分为一些相对独立的子图,并结合中医理论得到一些具有应用价值的中药组合。令最大分组值为5,迭代25次,得到了27个子群。通过分析,发现有4个子群可以针对某些证候发挥作用,详见表3。
表3 凝聚子群及适应证型分析
由于以此聚类的中药组合味数较多,为了便于进一步分析中药可能存在的组配关系,本文使用CONCOR迭代相关收敛法将中药子群图分为更小的独立子图,并在中医基础理论指导下对中药组合给出一些合理的解释,这为中药新药处方发现提供了新的途径。
本文以表3中的子群1为例介绍二级子群的聚类分析过程。为了计算方便,在使用CONCOR迭代相关收敛法进行二次凝聚子群计算时输入的数据为中药加权相关矩阵,见表4。首先计算出这个网络的Density(Matrix Average)=45.051 5,Standard Deviation= 38.527 0。令最大分组值为4,迭代25次,我们将这个网络进一步聚成9个二级子群,具体关系见图1。同时计算了二级子群的密度,展示了9个二级子群内部的关系和二级子群之间的关系,见表5。
图1 二级凝聚子群的关系图
表5 二级凝聚子群的密度表
从表5中可以看出,二级子群2,二级子群6,二级子群9的内部密度大于网络平均密度,说明这些二级子群中包含的药物自身之间的配伍比较频繁。其中,二级子群2的密度最大,说明他们包含的中药的关系非常紧密。由于二级子群5,二级子群7,二级子群8仅有一味中药,因此它的子群密度为空。
二级子群2与二级子群3,二级子群4,二级子群6,二级子群7,二级子群8,二级子群9的合作密度大于网络平均密度说明二级子群2为核心药物子群,经常与其他6个二级子群配伍,该7个二级子群可能经常成方使用。而二级子群1和二级子群5,不论是内部密度还是合作密度均很小,说明这些子群中的中药经常独立使用。
从中药网络的中心性分析结果可以看出,丹参,川芎,黄芪,红花和三七为治疗心绞痛血瘀证的核心药物,它们无论是在和其他中药连接的关系上,还是在其他中药之间相连的最短路径上担当“中介”角色,或是相对不受其他中药的影响等方面,这几味药都位于重要位置。值得一提的是,人参、郁金等中药虽然使用频次不是很高,但是它们的点度中心度、接近中心度和中间中心度却较高,表明这些中药在整个治疗心绞痛血瘀证的中药网络中也非常重要。
通过凝聚子群分析,我们得到了4个针对某些证候治疗的中药组合。通过进一步计算网络密度,我们分析了中药之间的组配关系。以子群1为例,我们计算了二级凝聚子群的密度,展示了常用药对,以及可能比较常见的配伍组合。从中医理论上看,子群1组成的药方以益气活血,兼有宽胸理气之效,可以丹参、黄芪两味常用药为君药,丹参善能通行血脉,祛瘀止痛,黄芪善能补气以行血,两药合用益气活血,辅以三七化瘀止痛,葛根升阳活血止痛,可视为臣药。薤白、瓜蒌合用正合《金匮要略》中治疗胸阳不振,气滞痰阻之胸痹证经方“瓜蒌薤白白酒汤”[15],起到通阳活血,宽胸行气之功,同时与活血化瘀之川芎、赤芍、红花、当归,兼以甘草缓急止痛,枳壳行气开胸,桃仁入心肝血分,泄血滞,这些药可视为佐使药,辅助君臣药行通阳宽胸,活血理气、通络止痛之效。
尽管本文使用复杂网络得出了治疗心绞痛血瘀证的一些用药规律,但是这些规律需要临床专家进一步解释和验证,这也将成为本课题组今后研究工作的一个方面。
[1]World Health Organization.The top ten cause of death.http://www. who.int/mediacentre/factsheets/fs310_2008.pdf.
[2]Thomaes T,Thomis M,Onkelinx S,et al.Reliability and validity of the ultrasound technique tomeasure the rectus femorismuscle diameter in older CAD-patients[J].BMCMed Imaging,2012,12:7.
[3]毛静远,牛子长,张伯礼.近40年冠心病中医证候特征研究文献分析[J].中医杂志,2011,52(11):2958-960.
[4]邢雁伟,李尊,王阶,等.冠脉病变特征和中医证候要素关系的研究[J].辽宁中医杂志,2008,35(1):36-38.
[5]龙伟,邳馨,向剑,等.中药方剂网络与中药化学空间的构建与分析[J].北京中医药大学学报,2011,34(11):729-732,740.
[6]刘志华,孙晓波.网络药理学:中医药现代化的新机遇[J].药学学报,2012,47(6):696-703.
[7]张润顺,周雪忠,姚乃礼,等.基于复杂网络分析的肝脾不调证的配伍特点研究[J].世界科学技术:中医药现代化,2010,12(6):882-887.
[8]李明,佟琳,张伟娜,等.汉唐止痛方剂的复杂网络方法分析[J].中医药信息,2012,29(3):22-24.
[9]高铸烨,张京春,徐浩,等.用复杂网络挖掘分析冠心病证候-治法-中药关系[J].中西医结合学报,2010,8(3):238-243.
[10]雷蕾,崔蒙,秘仲凯.关联规则挖掘在治疗肺癌组分中药发现中的应用研究[J].中国中药杂志,2010,35(16):2192-2195.
[11]赵君霞.复杂网络在中医临床知识发现中的应用研究[D].北京:北京交通大学,2009.
[12]吴江.凝聚子群分析构建自动分类网络地图[J].图书馆学研究,2010,30(2):56-62.
[13]沈娟华.基于相关矩阵和混合指数分布的聚类分析[D].苏州:苏州大学,2007.
[14]刘军.整体网分析讲义UCINET软件实用指南[M].上海:世纪出版集团,2009:97-147.
[15]孟如.金匮要略选读[M].上海:上海科学技术出版社,1997:55.
(2013-03-27收稿)
Study on Formulating Rules of Chinese Herbal Formula for Treating Angina Blood Stasis Syndrome
Lei Lei1,Yang Ce1,Wen Xianrong1,Xing Yanhui1,Liu Jun2,Wang Zhong2
(1 Institute of Information on Traditional Chinese Medicine,Academy of Chinese Medicine Sciences,Beijing 100193,China;2 Institute of BasiCResearch in Clinical Medicine,China Academy of Chinese Medical Sciences,Beijing 100700,China)
Based on clinical data of TCMformula for treating angina blood stasis syndrome,a Chinese herbal network for treatment of angina blood stasis syndrome was built up by using scale-free network,degree centrality,betweenness centrality and closeness centrality of Chinese herbswere calculated,and subgroup analysiswas performed by using CONCORmethod.Itwas found that salviamiltiorrhiza,rhizoma ligusticiwallichii,astragalus root,safflower and radix Notoginseng exhibit high centrality,indicating they were crucial component of the formula to treat of angina blood stasis syndrome.Twenty seven subgroups were discovered,four subgroups are valuable for new TCMformula design.In order to analyze potential compatibility of Chinese herbs,CONCOR analysiswas performed on subgroups to obtain network density,and provided explanations froMChinesemedicine theory.Conclusion:Scale-free network calculation is a useful method to design TCMformula for treating angina blood stasis syndrome.
Scale-free Network;Angina blood stasis syndrome;Centrality;Subgroup analysis;Ucinet
10.3969/j.issn.1673-7202.2013.09.035
863计划课题(编号:2006AA01A122)中国中医药科学数据网格服务应用,负责人:崔蒙;中国中医科学院基本科研业务费自主选题项目(编号:ZZ050305),基于支持向量机的中药组分药理作用预测模型的研究,负责人:雷蕾;“重大新药创制”科技重大专项“大品种药物IV期临床试验及新药临床试验审评研究技术平台”子课题-“丹红注射液IV期临床试验研究”(编号:2011ZX09304-07),负责人:南景一
王忠,研究员,主要研究方向:中药临床药理及疗效评价,Tel:010-64014411-3308,E-mail:zhonw@vip.sina.com