王远明 杜惠容 陈 恒 张 辉
四川省资中资州医院儿科,四川资中 641200
16S rRNA基因检测对新生儿败血症诊断价值的Meta分析
王远明 杜惠容 陈 恒 张 辉
四川省资中资州医院儿科,四川资中 641200
目的16S rRNA基因检测是诊断新生儿败血症的方法之一,但是尚无研究综合评价其诊断价值,本研究拟系统评价16S rRNA基因检测在新生儿败血症中的诊断价值。 方法 在Cochrane图书馆、Medline、Embase、Science Direct、中国期刊全文数据库、万方、维普等数据库中查找利用16S rRNA基因检测诊断新生儿败血症的文献。QUADAS工具评价纳入文献的质量,Meta-Disc 1.4软件检验异质性并根据其结果选择相应效应模型计算纳入研究的合并敏感性、特异性等指标,绘制汇总受试者工作特征(SROC)曲线,综合评价16S rRNA基因检测的诊断价值。 结果 共有8篇文献共计2 543例新生儿纳入本次研究,Meta分析显示16S rRNA基因检测对新生儿败血症的合并诊断价值分别为:敏感度为0.93,特异度为0.97,阳性似然比为25.12,阴性似然比为0.08,诊断比值比为323.40。SROC曲线下面积为0.99。 结论16S rRNA基因检测中对新生儿败血症具有较高的诊断价值,可作为诊断新生儿败血症重要工具。
16S rRNA;新生儿败血症;Meta分析
新生儿败血症指新生儿期细菌进入血液循环并进行繁殖释放毒素进而导致全身性感染,是导致新生儿死亡的重要的原因之一[1]。新生儿败血症发生率占活产儿的0.1%~1.0%,在早产儿中发生率更高,病死率为高达10%~50%,因此,早期诊断新生儿败血症是治疗的关键[2]。新生儿败血症的临床表现不典型,其诊断“金标准”仍依赖于血培养,该检查敏感度低并且耗时长,难以早期诊断,临床上正在探索新的诊断工具[3]。
细菌16S核糖体核糖核酸 (16S ribosomal ribonucleic acid,16S rRNA)基因具有高度保守性,在细菌鉴定中发挥重要作用,为临床细菌感染提供了快速、灵敏的检测方法[4]。正是鉴于此,临床上正在开展16S rRNA基因检测用于诊断新生儿败血症,并取得了不少进展[5]。利用16S rRNA基因检测诊断新生儿败血症已有不少研究发表,本研究拟综合评价16S rRNA基因检测诊断新生儿败血症的准确性。
1.1 一般资料
主要依据文献的检索与纳入。检索的主要数据库包括:Cochrane 图书馆、Medline、Embase、Science Direct、 中国期刊全文数据库、万方、维普等数据库,并对入选文献的参考文献进行手工检索。检索起始日期不限,截止日期到2012年4月。主要检索词包括:16S rRNA、neonatal sepsis、新生儿败血症等。只有同时提供利用16S rRNA诊断新生儿败血症的敏感度和特异度的并且样本量大于20的临床研究才能纳入。对于有重复发表可能的文章,经王远明、杜惠容两名评价员协商后选用质量最优的文献。
1.2资料提取与质量评价
由上述两名评价员参照诊断性试验准确性质量评价工具(quality assessment of diagnostic accuracy studies,QUADAS)评价文献质量,分别对14个条目的判断标准进行评价[6]。提取文献中的研究信息主要包括:作者、发表时间、患者数量、金标准、检测方法、灵敏度与特异度等临床背景资料,直接获取或根据文献提供的信息计算四格表数据。所有操作均独立进行并交叉核对,如遇分歧,以小组讨论的方法解决。
1.3 统计学方法
所有操作按照诊断性Meta分析的标准操作指南进行[7]。分别提取各独立研究的灵敏度与特异度,绘制汇总受试者工作特征曲线(SROC)曲线[8],评估16S rRNA基因检测诊断新生儿败血症的总诊断精度。卡方检验对敏感度、特异度进行异质性分析并根据其检测结果选择相关的效应模型。以I2评价异质性大小,I2≥50%提示各研究之间存在显著异质性。根据选择的效应模型计算纳入研究的合并敏感度、特异度、阳性似然比、阴性似然比和诊断比值比等指标。本Meta分析采用Meta-Disc 1.4软件。
2.1 纳入文献特点及质量评价
经两名评价员独立评价,共有8篇文献共计2 543例患儿符合本次Meta分析的要求[9-16],发表时间跨度为1998~2010年,包含6篇中文文献,2篇英文文献。所有研究均采用聚合酶链反应(PCR)法检测血液标本中的16S rRNA。所有纳入文献均能提供或计算出敏感度和特异度,纳入研究的基本临床资料、样本量、质量评价等信息详见表1。
质量评价发现各研究之间差距较大,QUADAS评分在7~12分,有4篇文章的QUADAS评分≥10分。
2.2 异质性检验
异质性检验的目的在于评价统计合并不同研究的精确估计是否恰当并根据其检验结果选择合适的效应模型。敏感度、特异度的 χ2检验值分别为 17.97(P=0.01,I2=61.1%)和10.81(P=0.15,I2=35.3%),表明各个研究的敏感度存在明显的异质性,综合考虑本次Meta分析采用随机效应模型。
2.3 Meta分析
将纳入的研究数据进行合并,合并敏感度为0.93[95%CI(0.89,0.96)](图 1),特异度为 0.96[95%CI(0.96,0.97)](图2),阳性似然比为 25.12[95%CI(17.40,36.27)],阴性似然比为0.08[95%CI(0.04,0.16)],合并诊断比值比为 323.40[95%CI(131.59,794.83)]。16S rRNA基因检测诊断新生儿败血症的SROC曲线见图3。SROC曲线是对试验特性的总体概括,曲线越靠近左上角,曲线下面积(AUC)越接近于1,该诊断性试验的诊断效能则越高。本次Meta分析显示灵敏度与特异度最大交点的均值为0.96,AUC为0.99,提示该试验的总诊断效率非常高。
本次Meta分析共纳入8项研究共计2 543例新生儿,其中包括224例新生儿败血症患儿和2 319例对照新生儿。Meta分析结果显示16S rRNA基因检测诊断新生儿败血症的合并敏感度为0.93,特异度为0.96,SROC曲线分析显示AUC为0.99,提示16S rRNA基因检测诊断新生儿败血症的准确度非常高,在临床筛查和确诊方面都具有非常高的价值,可作为新生儿败血症的可靠诊断工具。
图1 16S rRNA基因检测诊断新生儿败血症敏感度的森林图
图2 16S rRNA基因检测诊断新生儿败血症特异度的森林图
本文中笔者分别计算了反应诊断性试验准确性的几个指标,诊断比值比其定义为病例组中诊断试验阳性的比值和对照组中诊断试验阳性的比值,其值越大诊断性试验的诊断价值越大[17],本研究的诊断比值比为323.40,提示16S rRNA基因检测诊断新生儿败血症整体诊断效率相对较高。阳性似然比、阴性似然比也是诊断效率的测量指标[18],其中阳性似然比为25.12,表明新生儿败血症者中16S rRNA基因检测的阳性率大约是对照组的25倍。阴性似然比为0.08,提示16S rRNA基因检测结果若为阴性,则罹患新生儿败血症的可能性仅为8%,综合这两个指标对于诊断和排除新生儿败血症有很好的临床价值。
图3 16S rRNA基因检测的汇总受试者工作曲线
SROC曲线是对诊断性试验的总体概括[19],图3中每个点表示纳入的独立研究,体现了特异度与敏感度二者之间的关系,Q值是试验总体效能的测量指标,从SROC曲线左上角到右下角做一连线,与曲线的交点即为Q值,本次Meta分析的Q值为0.96,表示16S rRNA基因检测诊断新生儿败血症的最大联合敏感度和特异度为0.96,SROC曲线下面积为为0.99,提示16S rRNA基因检测具有非常高的临床诊断价值。
本次Meta分析虽然进行了全面的文献检索,严格按照诊断性Meta分析操作指南进行[20],但是仍有值得探讨之处。本次Meta分析由于语言限制,只纳入了中英文文献,存在语言偏倚;同时考虑到由于阳性结果的研究更容易发表的缘故,具有潜在的发表偏倚,这些偏倚可能会对Meta分析的结果造成影响。异质性分析显示各研究之间存在敏感度异质性,可能与所采用的具体技术手段、试验方法、所处的时代有差异有关。目前利用16S rRNA基因检测诊断新生儿败血症的手段相对比较成熟,其诊断效率较高,临床上在充分结合新生儿临床症状、其他检查结果的同时,尽早开展16S rRNA基因检测有助于临床上早期确诊新生儿败血症,进而早期干预,有望降低患儿的死亡率。
综上所述,笔者通过Meta分析从循证医学的角度探索了16S rRNA基因检测对新生儿败血症的诊断价值,结果显示16S rRNA基因检测诊断新生儿败血症具有高度的敏感性和特异性,可作为诊断新生儿败血症的有效工具。
[1]Stefanovic IM.Neonatal sepsis[J].Biochem Med,2011,21:276-281.
[2]Baltimore RS.Neonatal sepsis:epidemiology and management[J].Paediatr Drugs,2003,5(11):723-740
[3]Chiesa C,Panero A,Osborn JF,et al.Diagnosis of neonatal sepsis:a clinical and laboratory challenge[J].Clin Chem,2004,50(2):279-287.
[4]Teng LJ,Hsueh PR,Huang YH,et al.Identification of Bacteroides thetaiotaomicron on the basis of an unexpected specific amplicon of universal 16S ribosomal DNA PCR[J].J Clin Microbiol,2000,38(4):1727-1730.
[5]张芳,宋立.16S rRNA基因检测在新生儿败血症早期诊断中的研究进展[J].医学综述,2006,12(17):1035-1039.
[6]Whiting PF,Weswood ME,Rutjes AW,et al.Evaluation of QUADAS,a tool for the quality assessment of diagnostic accuracy studies[J].BMC Med Res Methodol,2006,6:9-20.
[7]Zamora J,Abraira V,Muriel A,et al.Meta-DiSc:a software for Metaanalysis of test accuracy data[J].BMC Med Res Methodol,2006,6:31.
[8]Devillé WL,Buntinx F,Bouter LM,et al.Conducting systematic reviews of diagnostic studies:didactic guidelines[J].BMC Med Res Methodol,2002,2:9.
[9]俞惠民,尚世强,洪文澜,等.用聚合酶链反应加反相杂交扩增细菌16SrRNA基因快速诊断新生儿败血症[J].中华围产医学杂志,1998,1(2):83-86.
[10]童美琴,尚世强,吴亦栋,等.16SrRNA基因PCR加基因芯片杂交快速诊断新生儿败血症[J].中华儿科杂志,2004,42(9):663-667.
[11]Shang S,Chen G,Wu Y,et al.Rapid diagnosis of bacterial sepsis with PCR amplification and microarray hybridization in 16S rRNA gene[J].Pediatr Res,2005,58(1):143-148.
[12]吴亦栋,尚世强,李建平,等.细菌16S rRNA基因荧光定量PCR诊断新生儿败血症[J].中华儿科杂志,2007,45(6):446-449.
[13]张芳,宋立,党立亨,等.细菌16S rRNA基因检测在新生儿败血症早期诊断中的临床意义[J].中华围产医学杂志,2007,11(3):169-172.
[14]Dutta S,Narang A,Chakraborty A,et al.Diagnosis of neonatal sepsis using universal primer polymerase chain reaction before and after starting antibiotic drug therapy [J].Arch Pediatr Adolesc Med,2009,163(1):6-11.
[15]楼金吐,吴亦栋,李建平,等.细菌革兰双检荧光定量PCR方法检测新生儿败血症[J].中华检验医学杂志,2009,32(5):547-551.
[16]张勤勤,龚华,吴高雄.16SrRNA基因在新生儿败血症诊断中的应用[J].中国妇幼保健,2010,25(31):4591-4592.
[17]Glas AS, Lijmer JG, Prins MH,et al.The diagnostic odds ratio:a single indicator of test performance[J].J Clin Epidemiol,2003,56:1129-1135.
[18]Deeks JJ.Systematic reviews in health care:Systematic reviews of evaluations of diagnostic and screening tests[J].BMJ,2001,323(7305):157-162.
[19]Akobeng AK.Understanding diagnostic tests 3:Receiver operating characteristic curves[J].Acta Paediatr,2007,96(5):644-647.
[20]Leeflang MM,Deeks JJ,Gatsonis C,et al.Cochrane Diagnostic Test Accuracy Working Group.Systematic reviews of diagnostic test accuracy[J].Ann Intern Med,2008,149(12):889-897.
Meta-analysis of value of 16S rRNA gene detection in diagnosis of neonatal sepsis
WANG YuanmingDU HuirongCHEN HengZHANG Hui
Department of Pediatrics,Zizhong Hospital of Zizhong,Sichuan 641200
Objective16S rRNA gene detection is one of the methods for the diagnosis of neonatal sepsis,but there is not any study evaluating its diagnostic value comprehensively.So this study aims to evaluate the diagnostic value of 16S rRNA gene detection in neonatal sepsis comprehensively.MethodsLiterature on diagnosis of neonatal sepsis using the 16S rRNA gene detection was searched in Cochrane Library,Medline,Embase,Science Direct,CNKI,Wanfang,VIP and other databases.QUADAS tool was used to evaluate the quality of literature;Meta-Disc 1.4 software was used to test heterogeneity,based on which the relevant effect model was selected to calculate the combined sensitivity,specificity and other indicators of the literature,the summary receiver operating characteristic(SROC)curve was drawn and the diagnostic value of 16S rRNA gene detection was evaluated comprehensively.ResultsA total of 8 pieces of literature including 2 543 neonates were included in this study.Meta-analysis showed that the combined diagnostic value of 16S rRNA gene detection in neonatal sepsis was as follows:sensitivity was 0.93,specificity was 0.97,positive likelihood ratio was 25.12,negative likelihood ratio was 0.08,diagnostic ratio was 323.40.Area under the SROC curve was 0.99.Conclusion16S rRNA gene detection has high diagnostic value in neonatal sepsis and therefore can be used as an important tool for the diagnosis of neonatal sepsis.
16S rRNA;Neonatal sepsis;Meta-analysis
R722.13
A
1673-7210(2012)08(c)-0011-03
王远明(1963-),男,汉族,本科,副主任医师,长期从事儿科疾病的治疗与研究。
;TP为真阳性;FP为假阳性;FN为假阴性;TN为真阴性;PCR为聚合酶链反应;QUADAS为诊断性试验质量评价工具
编号* 研究者 时间(年) 检验方法 诊断标准 TP FP FN 9 10 11 12 13 14 15 16俞惠民童美琴Shang S吴亦栋张芳Dutta S楼金吐张勤勤1998 2004 2005 2007 2008 2009 2009 2010 PCR PCR PCR PCR PCR PCR PCR PCR TN QUADAS(分)48血培养、临床诊断血培养血培养血培养血培养、临床诊断血培养血培养血培养882 0 7992 10 11 12 34 50 32 9 3271 981 08 60007200 70 268 155 787 63 183 470 248 297
2012-04-17 本文编辑:谷俊英)