基因组Mapping系统索引构建原理
2012-04-29 00:44国宏哲王亚东
智能计算机与应用 2012年4期
国宏哲 王亚东
摘要： 基因组mapping是将由高通量测序技术产生的大量短read数据映射到人类参考基因组，对基因组表达量分析，SNP位点预测及疾病预测有重要意义。首先，介绍基因组mapping的研究背景和研究现状， 介绍mapping系统中索引构建的基本概念和主要方法，并重点分析基于BWT结构的索引构建原理，同时也介绍序列比对的主要加速方法。最后，以总结BWT技术和mapping系统索引构建中涉及的相关方法和原理，揭示了新型索引技术的本质。
关键词：
中图分类号：TP391文献标识码：A文章编号：2095-2163（2012）04-0047-03
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